white spot        BIP BIP | KontaktFrançais | English

Pracownia Metod Teoretycznych, Obliczeń

i Informatyki

Kierownik prof. dr hab. n. farm. Aleksander Paweł Mazurek
22 851-43-85
22 841-18-88 w. 369
Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie obsługi.                     Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie obsługi.

 


Działalność Zakładu

Działalność naukowa
Współpraca

Publikacje


Zespół Metod Teoretycznych

Prof. dr hab. Joanna Sadlej
22 851-52-30
22 841-48-69 wew. 355
Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie obsługi.

Doc. dr hab. Jan Czesław Dobrowolski
22-851-52-30
22 841-48-69 wew. 355
Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie obsługi.

Dr Małgorzata Jarończyk
22 851-52-30
22 841-48-69 wew. 355
Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie obsługi.

Dr Wojciech Ozimiński
22 851-52-30
22 841-48-69 wew. 166
Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie obsługi.


Zespół Fizykochemiczny

Dr. Franciszek Pluciński
22 841-48-69 wew. 440
Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie obsługi.

Mgr n. farm. Krzysztof Pawłowski
22 841-48-69 wew. 447
Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie obsługi.

 


Działalność naukowa

Badania prowadzone są za pomocą metod chemii kwantowej i metod modelowania molekularnego z wykorzystaniem technik komputerowych.

Najważniejsze problemy badawcze dotyczą:

  • substancji aktywnych wobec receptorów histaminowych i serotoninowych,
  • wiązania wodorowego molekuł czynnych farmakologicznie,
  • izomerii cząsteczek aktywnych biologicznie m.in. konformacji, tautomerii, i efektu podstawnikowego
  • spektroskopii IR, VCD i NMR molekuł o znaczeniu farmakologicznym,
  • izomerii topologicznej,
  • badania molekularnych mechanizmów oporności wielolekowej komórek wobec leków przeciwnowotworowych z wykorzystaniem chemii kwantowej.

Współpraca

  • Ośrodkami naukowymi w kraju: Wydział Chemii UW, Instytut Chemii Przemysłowej, Instytut Chemii Fizycznej PAN, Instytut Chemii Organicznej PAN, SGGW, PZH, Instytut Chemii Akademii Świętokrzyskiej, Interdyscyplinarne Centrum Modelowania Matematycznego i Komputerowego UW.
  • Ośrodkami naukowymi za granicą: University of Tromso w Norwegii; Hebrew University w Jerozolimie, Uniwersytet Isparta, Turcja.

Wybrane publikacje

  • J. Sadlej, J. Cz. Dobrowolski, J. E. Rode, M. H. Jamróz,
    Density Functional Theory Study on Vibrational Circular Dichroism as a Tool for Analysis of Intermolecular Systems: (1:1) Cysteine-Water Complex Conformations,
    J. Phys. Chem. A, 2007,111,10703-10711.
  • J. Cz. Dobrowolski, M. H. Jamróz, R. Kołos, J. E. Rode, J. Sadlej,
    Theoretical prediction and the first IR-matrix observation of several L-cysteine molecule conformers,
    ChemPhysChem., 2007,8, 1085-1094.
  • J. K Maurin, F. Pluciński, A. P Mazurek, Z. Fijałek
    The usefulness of simple X-ray powder diffraction analysis for counterfeit control-The Viagra((R)) example.
    J Pharm Biomed Anal. 2007, 43, 1514-1518
  • J. E. Rode, J. Cz. Dobrowolski,
    Variation of BCP ellipticities in the course of the pericyclic and pseudopericyclic [2 + 2] cycloaddition reactions of cumulenes,
    Chem. Phys. Lett., 2007,449, 240-245.
  • M. E. Jamróz, M. Jarosz, J. Witowska-Jarosz, E. Bednarek, W. Tęcza, M. H. Jamróz, J. Cz. Dobrowolski, J. Kijeński,
    Mono-, di-, and tri-tertbutyl ethers of glycerol. A molecular spectroscopic study,
    Spectrochim. Acta, A., 2007,67,980-988.
  • J. Cz. Dobrowolski, J. E. Rode, J. Sadlej,
    Cysteine conformations revisited,
    J. Mol. Struct. (Theochem), 2007,810,129-134.
  • W. P. Ozimiński, P. Garnuszek, E. Bednarek, J. Cz. Dobrowolski,
    The Pt(II) and Pt(IV) Complexes with Histamine,
    Inorg. Chim. Acta, 2007,360,1902-1914.
  • J. E. Rode, J. Cz. Dobrowolski,
    An ab Initio Study on the Allene-Isocyanic Acid and Ketene-Vinylimine [2+2] Cycloaddition Reactions Paths
    J. Phys. Chem., 2006, 110, 3723-3737.
  • J. Sadlej, J. Cz. Dobrowolski, J. E. Rode, M. H. Jamróz,
    DFT study of vibrational circular dichroism spectra of D-lactic acid-water complexes,
    Phys. Chem. Chem. Phys., 2006. 8,101-113.
  • J. E. Rode, J. Cz. Dobrowolski,
    The Reaction Paths of the [2+2] Cycloaddition of the X=C=Y Molecules (X, Y=S or O or CH2). An ab Initio Study,
    J. Phys. Chem., 2006, 110, 207-218.
  • M. Grudzień, F. Pluciński, A. P Mazurek
    Molecular properties of econazole and sulconazole relevant to bioavailability
    Acta Pol Pharm 2006, 63, 465-466.
  • W. P. Ozimiński, J. Cz. Dobrowolski,
    On tautomerism, planarity, and vibrations of phospholes,
    Chem. Phys., 2005, 313,123-132.
  • M. Jarończyk, J Cz. Dobrowolski, Aleksander P. Mazurek,
    Tautomerism of 1,3-diphospholes. A DFT study,
    Chem. Phys. Lett., 2005, 406,173-178.
  • J. Cz. Dobrowolski, J. E. Rode, R. Kołos, M. H. Jamróz, K. Bajdor, A. P. Mazurek,
    Ar-matrix IR Spectra of 5-Halouracils Interpreted by Means of DFT Calculations,
    J. Phys. Chem., 2005, 109, 2167-2182.
  • J. Cz. Dobrowolski, A. P. Mazurek,
    Model Carbyne vs. Ideal and DNA Catenanes,
    J. Chem. Inf. Model., 2005, 45,1030-1038.
  • J. Cz. Dobrowolski, J. Sadlej, A. P. Mazurek,
    An ab initio study on monocyclic ?-lactam antibiotics,
    J. Mol. Struct. (Theochem),684(2004)181-186.
  • J. E. Rode, E. D. Raczyńska, E. Górnicka, J. Cz. Dobrowolski,
    Low inversion energy barrier of cytisine NH group - an expanation for the FT-IR signals splitting,
    J. Mol. Struct., 2005, 749, 51-59.
  • J. Cz. Dobrowolski, R. Kawęcki,
    Interaction of sulfinimines with boron trifluoride. A theoretical study,
    J. Mol. Struct., 2005, 734, 235-239.
  • M. Jarończyk, J. Cz. Dobrowolski, A. P. Mazurek,
    Theoretical studies on tautomerism and IR spectra of pyrazole derivative,
    J. Mol. Struct. (Theochem),2004,673, 17-28
  • W. P. Ozimiński, J. Cz. Dobrowolski, A. P. Mazurek,
    DFT studies on tautomerism of C5-substituted 1,2,4-triazoles,
    J. Mol. Struct. (Theochem), 2004, 680, 107-115
  • J. Cz. Dobrowolski, J. Sadlej, A. P. Mazurek,
    An ab initio study on monocyclic ?-lactam antibiotics,
    J. Mol. Struct. (Theochem),2004, 684, 181-186.
  • A. A. Strzelczyk, M. Jarończyk, Z. Chilmonczyk, A. P. Mazurek, E. Chojnacka-Wójcik, I. Sylte,
    Intrinsic activity and comparative molecular dynamics of buspirone analogues at the 5-HT1A receptors
    Biochem. Pharmacol., 2004, 67, 2219-2230
  • E. Górnicka, J. E. Rode, E. D. Raczyńska, B. Dasiewicz, J. Cz. Dobrowolski,
    Experimental (FT-IR and Raman) and theoretical (DFT) studies on the vibrational dynamics in cytisine,
    Vibr. Spectr. 2004, 36, 105-115.